V Praze se každý den promítalo v devíti kinech, přičemž každé uvádělo určitou tematickou řadu. Těchto sekcí bylo celkem pětadvacet: Cestami Romů, Česká cesta, Divné videofilmy, Festivalové vavříny, Italské filmy - Vidět Neapol..., Jak jsme co dělali v socialismu, Na východ od Prahy, Nové portugalské filmy, Nové ruské filmy, Nové řecké filmy, Novinky české tvorby, Novinky světové tvorby, Poklady z archívu ČT, Projekt 100, Proměny životního stylu - dokumenty, Přehlídka britské kinematografie, Přehlídka belgické kinematografie, Přehlídka chorvatské kinematografie, Přehlídka izraelské kinematografie, Přehlídka francouzské kinematografie, Retrospektiva Karena Šachnazova, Retrospektiva polského dokumentu, Retrospektiva Wima Wenderse, Současná TV tvorba a To nejlepší z Febia.
V rámci Febiofestu ’99 byly uvedeny jak filmy, které si svou českou premiéru už dávno odbyly, tak žhavé novinky a starší filmy, které se do Čech zatím z nejrůznějších důvodů nedostaly. Do této poslední skupiny spadají především snímky ze sekce Divné videofilmy, jako například kultovní animovaný film Heavy Metal nebo Drtič mozků.
"Vždycky nás festival vyčerpá, ale vždy pak zjistíme, že to má smysl," přiznává Fenič. Čísla, která šestou přehlídku filmu, televize a videa provázela, jsou vskutku rekordní. Program zahrnoval 424 snímků, z toho asi třetinu hraných a dvacet uváděných v tuzemsku vůbec poprvé.